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编号:13547187
基于网络药理学探讨丹参酮IIA治疗脊髓损伤的可能机制及相关通路(3)
http://www.100md.com 2019年6月1日 《世界中医药》 201911
     2.3 丹参酮IIA治疗SCI相关靶点的收集 将丹参酮IIA作用靶点与SCI相关发病机制靶点基因进行映射比较,发现157个共同基因,推测这些基因可能为丹参酮IIA治疗SCI的相关基因靶点。见图1。

    2.4 丹参酮IIA治疗SCI相关蛋白互作网络的构建与分析 丹参酮IIA治疗SCI的靶点蛋白互作网络结果详见图2,图中节点表示蛋白,边表示蛋白之间的关联,共涉及155个节点,1 129条边(其中VPS4、MMEL与其他蛋白没有相互作用,这2个蛋白不在相互作用网络中体现)。使用cytohubba插件中MCC方法计算后,确定最重要的5个蛋白互作关系(见图3),结果表明肿瘤蛋白p53(TP53)、Myc原癌基因蛋白(MYC)、G1/S-特异性周期蛋白-D1(CCND1)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、JUN原癌基因蛋白(JUN)可能是此网络中较为重要的蛋白靶点。

    2.5 GO分析 使用Metascape数据库对丹参酮IIA治疗SCI的相关靶点进行GO分析,结果BP分析(图4)中排名靠前的有药物反应(23个靶点/14.65%)、脂多糖反应(16个靶点/10.19%)、细胞对缺氧的反应(12个靶点/7.64%)、应对缺氧(14个靶点/8.92%)、细胞对DNA损伤刺激的反应(15个靶点/9.55%)等生物学过程 ......
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