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编号:13211939
基于分子模拟技术筛选大黄、羌活、秦艽的5—LOX、LTA4H抑制剂(4)
http://www.100md.com 2017年12月1日 中国中药杂志 2017年第23期
     2.4.2 LTA4H分子对接筛选 利用LTA4H所选晶体结构的原配体定义活性口袋,其活性口袋信息及计算结果见表4。将筛选得到的Fitvalue值高于阳性药(0.890 381)的化合物进行分子对接研究,将具有类药性质且匹配度在0.890 381以上的152个潜在活性化合物对接到活性口袋中,根据均方根偏差较低的原则,选择CDOCKER进行对接,对接阈值为61.90,以化合物打分值高于阈值,且与关键氨基酸发生相互作用为筛选原则,筛选得到2个大黄成分、3个羌活成分、2个秦艽成分,筛选结果见表6。

    大黄中的成分revandchinone 4与LTA4H中的GLY345、SER380、GLU384发生氢键相互作用,与PHE314、LEU369、PRO374、LYS565发生疏水性相互作用;羌活中的二十三烷酸与LTA4H中的TYR267、GLY268、ARG563发生氢键相互作用,与ALA137、TYR378发生疏水性相互作用;秦艽中的褐煤酸甲酯与LTA4H中的ARG537、LYS565发生氢键相互作用,与PHE314、VAL367、PRO382发生疏水性相互作 用 ......
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